اسیدفسفاتاز در بافت های بسیاری وجود دارد که عبارتند از: کبد، گلبول قرمز، مغز استخوان، پلاکت و مایع منی. سنجش اسید فسفاتاز به صورت گسترده و فوق العاده ای به عنوان یک آنزیم پروستاتی در زمانیکه سطح این آنزیم به عنوان یک علامت برای سرطان پروستات بالا رفته است استفاده می شود. سطح بالا رفته اسید فسفاتاز در زمانیکه مشکل پروستات وجود نداشته باشد، می تواند به علت بیماری کبدی و متلاشی شدن پلاکت و اریتروسیت های خون باشد. معمولاً سطوح بالای این آنزیم در بیمارانی که سرطان پروستات آن ها متاستاز کرده است مشاهده می شود و درجه افزایش سطح آنزیم می تواند نشان دهنده وسعت بیماری باشد. همچنین سطوح بالای این آنزیم به دلیل وجود آن در لیزوزوم های مغز استخوان در بیماری هایی که بر مغز استخوان اثر می گذارند، دیده می شود. سنجش این آنزیم در مستند کردن موارد تجاوز جنسی می تواند استفاده شود.