آنتی ترومبین III یک آلفا گلوبولین است که در کبد تولید می شود و سرین پروتئازهای درگیر در مسیر های انعقادی را مهار می کند و در نتیجه کمک مهمی به حالت هموستاز سیستم انعقادی می نماید. در هموستاز طبیعی، انعقاد از تعادل بین آنتی ترومبین III و ترومبین ایجاد می شود. افزایش در غلظت آنتی ترومبین، انعقاد یا تمایل به ترومبوز را افزایش می دهد و کمبود آن با تشکیل لخته می تواند همراه باشد. هپارین برای اثر بخشی خود نیاز به آنتی ترومبین III دارد و در بیماران با کاهش سطح این پروتئین، ممکن است به هپارین مقاوم شوند و نیاز به دوزهای بالای هپارین داشته باشند. سطوح بالای آنتی ترومبین III در هپاتیت، یرقان انسدادی و پیوند کلیه دیده می شود و در DIC و اختلالات کبدی سطح آن کاهش می یابد.