آپولیپوپروتئین B جزء اصلی لیپوپروتئین با دانسیته پایین (LDL) است و تقریباً 30% وزن LDL را تشکیل می دهد. آپولیپوپروتئین B به مقدار مساوی در روده و کبد سنتز می شود. Apo B یکی از پروتئین های اصلی حامل کلسترول در خون است و در حفظ یکپارچگی ساختاری و حلالیت لیپوپروتئین ها نقش مهمی را ایفا می کند. افزایش Apo B با افزایش ریسک ابتلا به بیماری های قلبی عروقی همراه است. برخی از نقص های ژنتیکی به صورت مستقیم باعث اختلال در Apo B می گردند، مانند هایپرلیپیدیمیای ارثی. افزایش Apo B در دیابت، پرکاری تیروئید و سندروم نفروتیک دیده می شود. مقدار Apo B در شرایطی مانند کم کاری تیروئید و سوء تغذیه می تواند کاهش پیدا کند.